Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LHX8Q68G74 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHX8Q68G74 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms