Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC3LQ587J8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms