Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTXN3Q4LDR2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN3Q4LDR2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms