Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRY2Q49AN0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CRY2Q49AN0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms