Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HFEQ30201 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HFEQ30201 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HFEQ30201 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms