Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGA3Q16281 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA3Q16281 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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