Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.014e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.049e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.044e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 214.79□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 XAB2-202ENST00000595288 4555 ntTSL 214.7□□□□□ -0.069e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-216ENST00000550867 2800 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.069e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ATP2A3-214ENST00000574999 776 ntTSL 314.64□□□□□ -0.074e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.085e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 214.51□□□□□ -0.099e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.25□□□□□ -0.132e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ZNHIT1-203ENST00000485387 2898 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.144e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 YIPF2-210ENST00000591872 430 ntTSL 214.13□□□□□ -0.159e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LCMT1-201ENST00000380962 1529 ntTSL 214.11□□□□□ -0.159e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-208ENST00000455877 591 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FDFT1-204ENST00000525283 898 ntTSL 314.07□□□□□ -0.164e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.179e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.96□□□□□ -0.189e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ULK1-202ENST00000537421 959 ntTSL 313.85□□□□□ -0.194e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.199e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-213ENST00000617847 1649 ntTSL 513.81□□□□□ -0.29e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-207ENST00000614394 1088 ntTSL 213.78□□□□□ -0.29e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-207ENST00000437103 571 ntTSL 413.78□□□□□ -0.24e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-213ENST00000457179 3061 ntTSL 513.69□□□□□ -0.225e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-230ENST00000553204 582 ntTSL 313.67□□□□□ -0.229e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.249e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.255e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-201ENST00000307364 2586 ntTSL 1 (best)13.45□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.269e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.269e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CORO7-227ENST00000575714 2978 ntTSL 513.37□□□□□ -0.279e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.299e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.299e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-210ENST00000532338 3451 ntTSL 213.18□□□□□ -0.34e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MIGA2-203ENST00000439290 4345 ntTSL 213.13□□□□□ -0.319e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NDUFA7-201ENST00000301457 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.329e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MIGA2-204ENST00000445183 3598 ntTSL 212.97□□□□□ -0.339e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.359e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.379e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-202ENST00000378600 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.389e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-204ENST00000378603 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.389e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-211ENST00000616278 960 ntTSL 212.65□□□□□ -0.389e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.49e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.49e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.419e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-10■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-225ENST00000584445 2484 ntTSL 212.3□□□□□ -0.449e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.479e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 512.08□□□□□ -0.485e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.499e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.529e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-216ENST00000487485 725 ntTSL 311.75□□□□□ -0.539e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LCMT1-204ENST00000564011 1168 ntTSL 511.74□□□□□ -0.539e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 511.71□□□□□ -0.549e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-211ENST00000578820 625 ntTSL 311.7□□□□□ -0.549e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NDUFA7-203ENST00000595856 553 ntTSL 511.55□□□□□ -0.569e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-212ENST00000456075 561 ntTSL 411.47□□□□□ -0.574e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GLYR1-210ENST00000589389 3606 ntTSL 1 (best)11.46□□□□□ -0.589e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RNF111-202ENST00000557998 4803 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.64e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-222ENST00000583908 430 ntTSL 311.02□□□□□ -0.659e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GATAD2A-205ENST00000418032 3480 ntTSL 210.94□□□□□ -0.669e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CASP2-204ENST00000472067 5769 ntTSL 210.84□□□□□ -0.674e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 210.8□□□□□ -0.685e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-210ENST00000473786 811 ntTSL 510.79□□□□□ -0.689e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ZNHIT1-202ENST00000461205 571 ntTSL 310.76□□□□□ -0.694e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-226ENST00000584513 500 ntTSL 310.49□□□□□ -0.739e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.744e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 NARF-227ENST00000584965 300 ntTSL 310.3□□□□□ -0.769e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 GLYR1-209ENST00000588732 3527 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.89e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LMBR1L-222ENST00000551782 567 ntTSL 410.07□□□□□ -0.89e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 HSF1-208ENST00000530661 552 ntTSL 310.04□□□□□ -0.84e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.829e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-212ENST00000482064 567 ntTSL 49.65□□□□□ -0.869e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 39.56□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.924e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 LRRC14-207ENST00000530242 93 ntTSL 39.27□□□□□ -0.939e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 ZNHIT1-204ENST00000492315 3958 ntTSL 29.21□□□□□ -0.934e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-206ENST00000612309 3101 ntTSL 28.42□□□□□ -1.069e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 DDB2-214ENST00000620515 347 ntTSL 38.39□□□□□ -1.079e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 28□□□□□ -1.139e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 TOP3B-208ENST00000437929 550 ntTSL 47.57□□□□□ -1.24e-8■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 CCT7-214ENST00000492253 531 ntTSL 47.57□□□□□ -1.29e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 27.41□□□□□ -1.229e-6■■■□□ 18.2
PCBP1Q15365 URGCP-204ENST00000439702 592 ntTSL 46.9□□□□□ -1.34e-8■■■□□ 18.2
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