Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF4GQ14541 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms