Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLF9Q13886 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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