Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP1A4Q13733 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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