Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4AQ13619 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4AQ13619 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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