Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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TMED1Q13445 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMED1Q13445 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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