Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RIGQ13278 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RIGQ13278 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RIGQ13278 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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