Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IFT88Q13099 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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