Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.092e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-9■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-9■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.312e-9■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-7■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-9■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-9■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.496e-15■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 512.69□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 35.55□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 515.88■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 19.2
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ILF3Q12906 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 ACSF3-215ENST00000544543 883 ntTSL 513.09□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 HM13-210ENST00000466766 358 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 ACSF3-216ENST00000562204 581 ntTSL 312.43□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.53e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-205ENST00000602546 762 ntTSL 310.05□□□□□ -0.83e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-208ENST00000602895 829 ntTSL 39.88□□□□□ -0.833e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-209ENST00000602920 625 ntTSL 29.12□□□□□ -0.953e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-210ENST00000602938 581 ntTSL 27.97□□□□□ -1.133e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 37.89□□□□□ -1.153e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-204ENST00000602294 502 ntTSL 27.81□□□□□ -1.163e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.363e-9■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 NOL9-204ENST00000464383 835 ntTSL 56.19□□□□□ -1.422e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 521.15■□□□□ 0.985e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 220.23■□□□□ 0.835e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-6■■■□□ 19.2
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