Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB40BQ12829 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms