Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms