Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSRP1Q08945 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSRP1Q08945 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms