Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN3Q08043 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms