Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SSBP1Q04837 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms