Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYP27A1Q02318 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP27A1Q02318 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms