Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms