Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF9Q00978 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF9Q00978 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms