Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FANCCQ00597 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCCQ00597 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms