Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms