Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MTCP1P56278 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTCP1P56278 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms