Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP1P56182 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP1P56182 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP1P56182 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP1P56182 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP1P56182 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP1P56182 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms