Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms