Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNI2P48788 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms