Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF9P41273 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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