Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms