Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NF2P35240 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NF2P35240 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NF2P35240 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NF2P35240 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NF2P35240 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NF2P35240 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NF2P35240 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NF2P35240 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NF2P35240 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NF2P35240 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NF2P35240 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms