Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRS3P32247 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BRS3P32247 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms