Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPS1P31327 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPS1P31327 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPS1P31327 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CPS1P31327 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CPS1P31327 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms