Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCND2P30279 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCND2P30279 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCND2P30279 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND2P30279 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND2P30279 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms