Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2AP24928 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2AP24928 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms