Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGFR4P22455 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGFR4P22455 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms