Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNB1P20700 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms