Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA2P17301 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA2P17301 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms