Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms