Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
TOP2AP11388 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TOP2AP11388 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms