Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSN3P07498 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSN3P07498 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSN3P07498 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSN3P07498 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms