Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC24BO95487 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24BO95487 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms