Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TIMM17BO60830 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms