Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms