Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTH3O43739 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms