Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRDCB7Z8K6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms