Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEURL1BA8MQ27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEURL1BA8MQ27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms