Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
V9GYS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GYS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
V9GYS6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
V9GYS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
V9GYS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
V9GYS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
V9GYS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
V9GYS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
V9GYS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
V9GYS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
V9GYS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
V9GYS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
V9GYS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
V9GYS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
V9GYS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYS6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
V9GYS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
V9GYS6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
V9GYS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
V9GYS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
V9GYS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
V9GYS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
V9GYS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
V9GYS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms