Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROG3Q9Y4Z2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROG3Q9Y4Z2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROG3Q9Y4Z2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEUROG3Q9Y4Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEUROG3Q9Y4Z2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROG3Q9Y4Z2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEUROG3Q9Y4Z2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEUROG3Q9Y4Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms